报告题目：CRISPR基因编辑与微生物底盘细胞的构建的新策略

报告时间：2025年5月9日（周五） 下午14:00-15:00

报告地点：3号楼307会议室

报告人：佘群新 教授 山东大学

邀请人：吴敏 研究员

摘要：基于CRISPR系统的基因编辑技术是当代生物学及其生物工程各方面研究的核心技术，也构成了合成生物学底盘细胞构建的基础。构建微生物底盘细胞中最重要的工作就是去除其冗余的基因，包括非必需基因的确定和敲除。微生物的非必需基因通常是通过比较基因组学、基于转座子的大规模基因失活实验以及计算机模拟等方法来确定的，但是，这些方法通常需要反反复复的trial-and-error的实验才能达到非必需基因的鉴定与敲除的目的。为了促进微生物基因组精简工作，我们以Saccharolobus islandicus, Escherichia coli和Bacillus subtilis为模式，验证了一个新的基因组大片段敲除的设计；这包括采用PCR筛选方法来促进基于CRISPR或RedET系统的必需基因鉴定，同时还结合使用新鉴定出的基因作为同源臂来简化含有未知必需基因的大片段序列敲除的过程。采用该策略，我们在上述古菌和细菌中获得了所设计的基因组精简的微生物细胞。此外，我们还建立了基于IS605转座子TnpB的基因编辑技术，并首次证明该RNA介导的核酸酶可在不同微生物中进行高效的单碱基编辑。采用这些新策略有望促进不同类型的微生物底盘细胞的构建与优化。